孫思邈生于西魏大統七年（541年），自謂“幼遭風冷，屢造醫門，湯藥之資，罄盡家產”，孫思邈幼年嗜學如渴，知識廣博，只是后來身患疾病，經常請醫生治療，花費了很多家財，于是，他便立志從醫。

孫思邈少年好讀，天資聰明，7歲的時候，就認識一千多字，每天能背誦上千字的文章，據《舊唐書》載，西魏大臣獨孤信對孫思邈十分器重，稱其為“圣童”。18歲時立志究醫，“頗覺有悟，是以親鄰中外有疾厄者，多所濟益”。到了20歲，就能侃侃而談老子、莊子的學說，精通道家典籍，被人稱為“圣童”，開始為鄉鄰治病。

修行終南

北周靜帝時，楊堅執掌朝政，召孫思邈任國子博士，孫思邈無意仕途功名，認為做高官太過世故，不能隨意，堅決不接受，一心致力于醫學。

隋開皇元年（581年），見國事多端，孫思邈隱居太白山中。他一方面下功夫鉆研醫學著作，一方面親自采集草藥，研究藥物學。認真研讀《黃帝內經》、《傷寒雜病論》、《神農本草經》等古代醫書，同時廣泛收集民間流傳的藥方，熱心為人治病，積累了許多寶貴的臨床經驗。他從理論到實踐，再由實踐經驗中提煉出新的醫藥學研究成果，以畢生精力撰成了醫學著作《千金要方》和《千金翼方》。 

應詔入京

唐太宗即位后，召孫思邈入京師長安，見到他70多歲的人竟能容貌氣色、身形步態皆如同少年一般，十分感嘆，便道：“所以說，有道之人真是值得人尊敬呀！像羨門、廣成子這樣的人物原來世上竟是有的，怎么會是虛言呢？”太宗想授予孫思邈爵位，但被他拒絕了，仍回到鄉間為民醫病。